2008. január 26-án, 64 évesen, megrendítő hirtelenséggel elhunyt. Habóczky Sándort a Körös-vidéki Környezetvédelmi és Vízügyi Igazgatóság saját halottjának tekinti.
hamvait 2007. december 11-én, kedden 15 órakor gyászmise keretei között helyezik örök nyugalomra a belvárosi Szent Anna templomban (Bp. Szervita tér 6.)